Η εγκατάσταση των Βενετών στο Χάνδακα συνοδεύτηκε από την εγκαθίδρυση μιας νέας τάξης πραγμάτων στα εκκλησιαστικά πράγματα του νησιού. Η εκκλησία της Ρώμης φρόντισε εξαρχής να καταστήσει σαφή την κυριαρχία της μέσω της ίδρυσης στο νησί Λατινικής Αρχιεπισκοπής, με έδρα το Χάνδακα. Παράλληλα, τα μοναστικά τάγματα, τα οποία από τα μέσα του 13ου αιώνα είχαν αναλάβει την προώθηση του ρόλο της Εκκλησίας στην κοινωνία, άρχισαν να οικοδομούν στο Χάνδακα χώρους για να στεγάσουν τις ποικίλες δραστηριότητές τους, που σταδιακά εξελίχθηκαν σε επιβλητικά συγκροτήματα. Από τα εκκλησιαστικά κτίσματα της πρώτης περιόδου της Βενετοκρατίας διασώθηκαν ελάχιστα κατάλοιπα, κυρίως λόγω των σεισμικών καταστροφών και των επανειλημμένων ανοικοδομήσεων.
 | 1. Ηράκλειο – Rabd el Khandaq – Χάνδακας- Candia – Μεγάλο Κάστρο. Η περιπέτεια μιας πόλης |  |
|---|---|---|
 | 1.1 Ο Χάνδακας στη Βενετοκρατία | |
 | 1.2 Τα δημόσια κτήρια | |
 | 1.2.1 Η Ruga Maistra | |
 | 1.2.2 Το Δουκικό ανάκτορο | |
 | 1.2.3 Η Ενετική Λέσχη (Loggia) | |
 | 1.2.4 Η αποθήκη των σιτηρών (Fondaco) | |
 | 1.2.5 Η πύλη Voltone | |
|
| 1.3 Οι ναοί του Ορθόδοξου δόγματος | |
 | 1.3.1 Αγία Αικατερίνη Σιναϊτών | |
 | 1.3.2 Αγία Αναστασία | |
 | 1.3.3 Άγιος Ματθαίος | |
 | 1.3.4 Άγιος Ονούφριος | |
 | 1.3.5 Παναγία των Αγγέλων | |
 | 1.3.6 Παντάνασσα (Μικρός Άγιος Μηνάς) | |
 | 1.4.1 Η δουκική εκκλησία του Αγίου Μάρκου | |
 | 1.4.2 Άγιος Ιωάννης ο Βαπτιστής | |
 | 1.4.3 Άγιος Παύλος των Σερβιτών | |
 | 1.4.4 Η μονή του Αγίου Φραγκίσκου | |
 | 1.4.5 Η παναγία των Σταυροφόρων | |
 | 1.4.6 Ο Άγιος Πέτρος των Δομηνικανών | |
 | 1.4.7 Ο Άγιος Τίτος | |
 | 1.4.8 Ο ναός του Σωτήρα | |
|
| 1.5 Οι κρήνες | |
 | 1.5.1 Η κρήνη της Ruga Panigra | |
 | 1.5.2 Η κρήνη Bembo | |
 | 1.5.3 Η κρήνη Morosini | |
 | 1.5.4 Η κρήνη Priuli | |
 | 1.5.5 Η κρήνη Sagredo | |