Στους λίγους ορθόδοξους ναούς της Βενετοκρατίας που διασώθηκαν συγκαταλέγεται ο μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός του Αγίου Ματθαίου. Χρονολογείται από επιγραφή στα τέλη της Βενετοκρατίας (1600) και είναι ο αρχαιότερος από ένα σύμπλεγμα τριών ναών, που οικοδομήθηκαν διαδοχικά. Πάνω από τη βόρεια είσοδο του ναού έχει εντοιχιστεί ανάγλυφη μαρμάρινη πλάκα που εικονίζει τον Ευαγγελιστή Ματθαίο ένθρονο. Στην περίοδο της Βενετοκρατίας τελούσε υπό την αιγίδα του σωματείου των βαρελοποιών. Αμέσως μετά την κατάληψη της Κρήτης από τους Οθωμανούς, αγοράστηκε από το Μεγάλο Διερμηνέα της Υψηλής Πύλης Παναγιωτάκη Νικούσιο και στη συνέχεια παραχωρήθηκε στη Μονή Αγίας Αικατερίνης Σινά. Για τον επόμενο ένα αιώνα ο ναός αποτελούσε το μοναδικό εν λειτουργία ορθόδοξο ναό του Χάνδακα.
1. Μπορμπουδάκης Εμμανουήλ, ‘Το Σιναϊτικό Μετόχι του Αγίου Ματθαίου, εργασίες αποκαταστάσεώς του και εικόνες’, Σιναϊτικά Μετόχια σε Κρήτη και Κύπρο, Ίδρυμα Όρους Σινά, Αθήνα, χωρίς έτος έκδοσης Περισσότερα
 | 1. Ηράκλειο – Rabd el Khandaq – Χάνδακας- Candia – Μεγάλο Κάστρο. Η περιπέτεια μιας πόλης |  |
|---|---|---|
 | 1.1 Ο Χάνδακας στη Βενετοκρατία | |
 | 1.2 Τα δημόσια κτήρια | |
 | 1.2.1 Η Ruga Maistra | |
 | 1.2.2 Το Δουκικό ανάκτορο | |
 | 1.2.3 Η Ενετική Λέσχη (Loggia) | |
 | 1.2.4 Η αποθήκη των σιτηρών (Fondaco) | |
 | 1.2.5 Η πύλη Voltone | |
|
| 1.3 Οι ναοί του Ορθόδοξου δόγματος | |
 | 1.3.1 Αγία Αικατερίνη Σιναϊτών | |
 | 1.3.2 Αγία Αναστασία | |
 | 1.3.3 Άγιος Ματθαίος | |
 | 1.3.4 Άγιος Ονούφριος | |
 | 1.3.5 Παναγία των Αγγέλων | |
 | 1.3.6 Παντάνασσα (Μικρός Άγιος Μηνάς) | |
|
| 1.4 Οι ναοί του Καθολικού δόγματος | |
 | 1.4.1 Η δουκική εκκλησία του Αγίου Μάρκου | |
 | 1.4.2 Άγιος Ιωάννης ο Βαπτιστής | |
 | 1.4.3 Άγιος Παύλος των Σερβιτών | |
 | 1.4.4 Η μονή του Αγίου Φραγκίσκου | |
 | 1.4.5 Η παναγία των Σταυροφόρων | |
 | 1.4.6 Ο Άγιος Πέτρος των Δομηνικανών | |
 | 1.4.7 Ο Άγιος Τίτος | |
 | 1.4.8 Ο ναός του Σωτήρα | |
|
| 1.5 Οι κρήνες | |
 | 1.5.1 Η κρήνη της Ruga Panigra | |
 | 1.5.2 Η κρήνη Bembo | |
 | 1.5.3 Η κρήνη Morosini | |
 | 1.5.4 Η κρήνη Priuli | |
 | 1.5.5 Η κρήνη Sagredo | |